Durante uma entrevista, a Digital Eclipse discutiu a exclusão de Ultimate Mortal Kombat 3 para Mega Drive da Mortal Kombat: Legacy Kollection. Dan Amrich explicou que, assim como Mortal Kombat Gold, a versão para Mega Drive não pôde ser incluída por falta de permissões adequadas. Apesar da capacidade de emular o jogo, a equipe ficou sem tempo para implementar essa versão específica na coletânea. Atualmente, existe a esperança de que ela possa ser adicionada como DLC no futuro, embora ainda não haja promessas definitivas sobre seu lançamento. O colecionável sairá para várias plataformas em 2025.